Le discours scientifique proposé encadre les paysages identifiés de la Baie de Somme : le milieu « terrestre » qui regroupe les bas-champs et marais d’eaux douce et saumâtre, le milieu marin avec son cordon littoral et la Pointe du Hourel, enfin la baie elle-même avec ses vasières et prés salés (slikke et shorre).
Telle une boussole, l’organisation de la Maison de la Baie s’oriente et s’inscrit dans son environnement géographique. Ainsi, le parcours du visiteur respecte l’orientation des grands paysages et explore la Maison comme un calque posé sur la Baie.
Au sortir du bâtiment, sous la verrière du grand patio lumineux, se reflète le ciel sur les surfaces de la grande carte qui se déploie en jardin-paysage.
